Problemi con mini indici e Classichethesis

Buongiorno a tutti,
Premetto che sono un completo neofita di Latex, quindi verosimilmente la soluzione al mio problema risiede in una banalità che mi sfugge per ignoranza.
Sto scrivendo la tesi di dottorato con il pacchetto classichthesis e vista l’articolazione di diversi capitoli, vorrei inserire l’indice delle sezioni all’inizio del capitolo.
Se non ho inteso male minitoc non è compatibile con classicthesis, quindi mi sono orientato verso titletoc e titlesec.
Tuttavia quando compilo, ottengo si gli indici delle sezioni dei capitoli, ma prima e dopo il capitolo, ottengo anche una lista di tutte le parti prima e dopo del capitolo in questione.
Una effetto di questo genere:

part.1chapter.1part.2chapter.2
2.1 Introduction 15
2.2 Diagnostic PCR for Opitutae bacteria 15
2.3 Phylogenetic analysis of Euplotes strains 16
2.4 Euplotes strain positive for Verrucomicrobia symbionts presence and related phylogenetic analysis 17
part.3chapter.3chapter.4section.4.1section.4.2subsubsection*.5subsubsection*.6subsubsection*.7subsubsection*.

Questo è il mio preambolo
`\documentclass[11pt,a4paper]{scrbook}
% Analogo di KOMA-Script della classe book
\usepackage[english]{babel}
\usepackage[parts,linedheaders,pdfspacing]{classicthesis}
\usepackage{lipsum}
\usepackage[utf8]{inputenc} % lettere accentate da tastiera
\usepackage{cite}
\usepackage{textcomp}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{capt-of}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{longtable}
\usepackage[skip=10pt]{caption}
\usepackage{subfig}
\usepackage{pdflscape}
\usepackage{placeins}
\usepackage{adjustbox}
\usepackage{titletoc}
\usepackage{titlesec}
\usepackage{hyperref}`

Questo è come genero il toc parziale

`\chapter{Screening for Verrucomicrobial symbionts}
\startcontents[Screening for Verrucomicrobial symbionts]
\printcontents[Screening for Verrucomicrobial symbionts]{}{1}{}
TESTO
\endcontest[Screening for Verrucomicrobial symbionts]`

Andando a smanettare e a fare prove di sottrazione dei vari elementi per capire chi va in conflitto con cosa. mi sembra di notare che i problemi appaiono quando strutturo il lavoro in parti.
Se qualcuno mi può aiutare o al limite suggerire una via alternativa per inserire questi indici, sarebbe ottimo
Grazie