In che classe? La domanda, senza specificare quale classe stai usando, è mal posta. Inoltre l’ambiente thebibliography usa \section nelle classi che non hanno capitoli, \chapter* in quelle che hanno i capitoli.
Nella classe scrreprt (con ClassicThesis).
Una sbirciatina in scrreprt.cls avrebbe rivelato che la definizione di \subsection è
`\newcommand\subsection{\@startsection{subsection}{2}{\z@}%
{-3.25ex\@plus -1ex \@minus -.2ex}%
{1.5ex \@plus .2ex}%
{\raggedsection\normalfont\sectfont\nobreak\size@subsection\nobreak
}%
}`
Un’occhiata al Companion avrebbe svelato gli arcani argomenti di \@startsection:
`#1 = nome
#2 = livello
#3 = rientro
#4 = spazio precedente
#5 = spazio seguente
#6 = stile`
Quello che ti interessa è il #4; il fatto che i numeri siano negativi indica che si desidera non rientrare il capoverso che segue, ciò che conta per la spaziatura è il valore assoluto.
Più avanti in scrreprt.cls si trova la definizione di thebibliography che richiama \@bibheading, che a sua volta chiama \chapter*
Ciao
Enrico