Caratteri accentati sotto Linux

Salve a tutti,
Non riesco a capire bene il problema legato ai caratteri accentati…Sotto windows ero solito inserire la seguente riga nel preambolo
`\usepackage[latin1]{inputenc}`
Tuttavia nel passaggio a Linux questa riga sembra inutile (attualmente sto utilizzando il programma TeXmaker). Sul sito ho trovato questa piccola spiegazione
http://www.guit.sssup.it/latex/suggerimenti.php
tuttavia non mi chiarisce totalmente le idee…Se non ho capito male, la codifica ASCII di per sé non supporta i caratteri accentati, di conseguenza sono necessarie altre tipologie di codifiche (tipo Latin1, utf8, ecc…): ogni sistema operativo utilizza una propria codifica (ma perché questo?) e quindi bisogna passare da una codifica all’altra. E’ giusto? Se tutto ciò che ho detto è giusto, non riesco a capire come mai questo problema è presente solamente con LaTeX: se ogni sistema operativo utilizza una propria codifica, perché questi problemi non li ho con altri programmi (tipo blocco note o OpenOffice)?

Ulteriore domanda non strettamente legata alle precedenti: come posso fare “l’accento” ALT+96 su TeXmaker? Se provo a farlo non mi appare nulla ed il programma passa da una pagina .tex all’altra