Hai provato a far compilare direttamente da TeXshop?
Quando io faccio grafici con MP, scrivendoli ed editandoli direttamente con TeXshop,seleziono metapost fra i motori di composizione che si possono scegliere nella finestrina di fianco al comando Typeset, su nella barra, poi clicco typeset, e mi ritrovo già con il disegno trasformato in file pdf, pronto per essere incluso. È vero che nei miei file MP non ho mai specificato di usare font diversi dai CM o dagli LM, con quel preambolo che ti ha mostrato Enrico, ma la procedura che segue TeXshop è preconfezionata per eseguire tutto quel che serve, compresa la trasformazione del risultato finale in formato pdf.
Prova; e facci sapere che cosa succede. Può darsi che con quel preambolo TeXshop non sia in grado di eseguire la compilazione usando la sintassi LATeX, invece che la semplice sintassi TeX; sarei curioso di saperlo.