Provo a indovinare: hai messo il comando \label prima del comando caption e così il \label recupera solo l’ultimo contatore riferenziabile che sia stato incrementato; per recuperare anche il numero della tabella devi mettere \label dopo che \caption ha incrementato il numero riferenziabile “table”
Se non e così, allora non ho idea da dove possa arrivare il tuo problema, almeno se stati usando classi e pacchetti “normali”.
\label l’ho messo dopo \captionof{}{}. Ho provato a spostare alcuni comandi del codice di Enrico ma ottengo riferimenti corretti solo a partire dalla seconda tabella. Riporto un esempio minimo:
`\documentclass{book}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{caption}
\usepackage{ifthen}
\makeatletter
\newsavebox{\ivan@box}
\newcounter{ivan@cntr}
\def\ivanvbox#1{\sbox\ivan@box{%
\stepcounter{ivan@cntr}\label{ivan@label\arabic{ivan@cntr}}%
\def\captionof##1##2{\gdef\@thisboxcaption{\captionof{##1}{##2}}\ignorespaces}
\unskip#1}% end of \ivan@box
\ifdim\wd\ivan@box<\columnwidth
\normalivan@box
\else
\bigivan@box
\fi}
\def\normalivan@box{%
\par\addvspace{\bigskipamount}
\noindent\parbox{\textwidth}{\centering
\@thisboxcaption\unhbox\ivan@box}
\par\addvspace{\bigskipamount}}
\def\bigivan@box{%
\par\addvspace{\bigskipamount}
\noindent\parbox{\textwidth}{\centering
\@thisboxcaption
\ifthenelse{\isodd{\pageref{ivan@label\arabic{ivan@cntr}}}}
{\def\ivan@side{l}}{\def\ivan@side{r}}%
\checkivan@wd
\makebox[\columnwidth][\ivan@side]{\box\ivan@box}}
\par\addvspace{\bigskipamount}}
\def\checkivan@wd{%
\ifdim\wd\ivan@box>\dimexpr\textwidth+\marginparsep+\marginparwidth\relax
Tabella troppo grande\\
\fi}
\makeatother
\begin{document}
\chapter{Primo}
Si veda la tabella \ref{tab:classe}
\ivanvbox{\captionof{table}{Classe frequentata}\label{tab:classe}
\begin{tabular}{cccccc}
\toprule
& 3 & 122 & 26,9 & 27,4 & 60,8\\
\bottomrule
\end{tabular}}
\end{document}`
Ciao
Ivan