A me, su 21 righe di testo effettive, con \mymarginpar[10000]{testo}, va a capo su 12 righe. Poi è perfettamente giustificato a parte uno spazio un po’ eccessivo alla prima linea tra Basso e assorbi\-mento.
Non capisco il problema. Io scrivo:
`
\documentclass{article}
\usepackage[italian]{babel}
\usepackage[T1]{fontenc}
\newcommand{\mymarginpar}[2][5000]{\marginpar{\footnotesize
\edef\oldtolerance{\the\tolerance}%
\tolerance=#1\relax
\hskip0pt
#2\par\tolerance=\oldtolerance}}
\begin{document}
\mymarginpar[10000]{Basso assorbimento, scattering e sorgente isotropi la teoria
della diffusione coincide con quella del trasporto: le sezioni d'urto sono indipendenti
dall'angolo, il termine di streaming non è presente e non ci sono condizioni al contorno
imposte sulle direzioni. L'equazione di accelerazione coincide con quella che è
accelerata e quindi l'autovalore si annulla.}
\end{document}
`
Inoltre è vero che le \vbox agiscono su \baseline, \lineskip e un \lineskiplimit.