Problema bibliografia

Salve a tutti,
sto scrivendo un articolo scientifico per uan rivista che mi ha fornito il template e il file degli stili .cls. Ho un problema però ho provato a inserire la bibliografia con bibtex a partire da quella che ho nel mio database generata con Jabref. Purtroppo ho degli errori, ovvero mi vengono inseriti dei punti interrogativi [?] al posto dei numeri e non ho alcuna bibliografia alla fine. Uso come editor winedit e come compilatore mmiktex 2.9.
Ho anche provato a fare un file semplicissimo senza usare il template del giornale ma ho sempre lo stesso errore. Sto compilando in latex.
Voglio precisare che quando usavo il file generato da Jabref per esempio nella mia tesi compilavo in pdflatex e non avevo alcun problema. Quindi deduco che il problema ce l’ho quando compilo in latex.
Qui vi metto cosa inserisco all’inzio del documento. Grazie

\documentclass{pj}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{mathrsfs}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{booktabs,amsmath,siunitx}
\usepackage{amsthm}
\usepackage{empheq}
\usepackage{multirow}
\usepackage{makeidx}
\usepackage{bibentry}
\usepackage[italian,english]{babel}
\usepackage[numbers]{natbib}

\bibliographystyle{ieeetr}

Hai fatto girare bibtex?

Ciao
Enrico

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