Ciao,
mi trovo coinvolto anche io nella scrittura della tesi per una laurea triennale (Scienze Agrarie presso Università di Pisa) e, come corretto, la mia Facoltà non impone un layout predefinito.
Personalmente, utilizzo il seguente preambolo:`\documentclass[a4paper,openright]{book}
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$\sim$\ #1}} \fancyhead[RE]{\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
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\fancyhead[LO]{\textsc{\nouppercase{\rightmark}}}
\renewcommand{\headrulewidth}{.25pt}
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Ciao.