Immagino che tu abbia consultato il sito http://en.wikipedia.org/wiki/Lithuanian_language
Da questo sito io ho capito quanto segue:
1) le vocali a, e, i, u possono prendere l’ogonek, che in LaTeX si indica con la macro epr accenti \k:
\k{a}, \k{e}, \k{i}, \k{u}; l’ogonek si applica anche alle maisucole.
2) le senza ogonek può prendere l’accento punto anche in maiuscolo \.e, \.E
3) la u può prendere la lunga anche in maiuscolo \=u, \=U
Fra le consonanti:
4) c, s e z possono prendere l’hachek (un piccolo circonflesso rovesciato) anche in maiuscolo; questo accento con LaTeX si indica con \v: \v{c}, \v{s}, \v{S}, \v{C}, \v{z}, \v{Z}.
Tutte le altre lettere dell’alfabeto cosiddetto latino sono identiche all’italiano e le trovi tutte sulla tua tastiera.
Naturalmente è noioso scrivere quelle macro per gli accenti, ma siccome non disponi di una tastiera lituana, non hai alternative; se dovessi copiare (copia e incolla) delle stringhe di testo lituane da un sito internet, o da documenti di vario genere, allora potrebbe farti comodo usare l’encoding utf8; ti risparmi di indicare gli accenti e potresti sperare che questa codifica, così come è implementata nel file di definizioni che accompagna TeX Live (forse anche MiKTeX) comprenda anche questo gruppo di lettere minuscole e il corrispondente gruppo di lettere maiuscole, che ti potrebbe far risparmiare molto tempo.
Attento a diritti di proprietà letteraria quando copi dalla rete o da altri documenti; va bene purché citi la fonte in modo inequivocabile e chiaro.