Re: classicthesis+Adobe Garamond Pro?

Non te lo so dire; non ho abbastanza esperienza con LuaLaTeX, ma so che si possono fare cose molto complesse; non credo che siano più semplici che applicare otftotfm al font Garamond Pro. La documentazione è ancora scarsa, ed è certamente più adatta per gli sviluppatori, che non per gli utenti “normali”. Ho visto anche cose egregie fatte con ConTeXt-mkiv, ma non credo che accetti direttamente il mark-up di LaTeX con cui è creata ClassicThesis.
Siccome il problema con ClassicThesi sembra essere la bibliografia, puoi sempre prendere in considerazione la possibilità di compilare il corpo del testo con XeLaTeX e la bibliografia con pdflatex, e poi congiungere i due file pdf tramite, per esempio, pdfpages.