Benvenuto!
L’esempio che hai inviato non è compilabile, ma si possono comunque dire alcune cose.
1) Il caricamento di setspace non fa presagire nulla di buono. Eviterei anche indentfirst, ma questa è una mia fissazione.
2) Le testatine e i piedini della prima pagina del capitolo sono definiti nello stile plain. Tu hai modificato lo stile fancy.
Il problema è noto e viene trattato nella doc di fancyhdr. Leggi bene la doc, che dovrebbe esistere anche in italiano.
3) Vedrei meglio il numero di pagina nel centro del piedino. Le testatine così sono un po’ troppo piene e
perdono la loro funzione.
4) Non capisco la questione della numerazione dopo il frontespizio. Dove sarebbe il forntespizio?
5) Prima di lanciarti a modificare stili di capitoli sezioni e testatine cerca qualche classe che ti aggrada. Ce ne sono parecchie.
La classe memoir dovrebbe soddisfare appieno il tuo desiderio (legittimo) di originalità grafica.
Ciao
Ivan