Tommaso ti ha già detto come fare.
In ogni caso, sapete come la penso: avere due motori per generare la bibliografia è come avere due motori LaTeX: il malcapitato utente rischia di fare confusione.
Anche LaTeX è ambiguo e ha due motori, forse anche 4; noi tutti usiamo spesso la metafora di scrivere LaTeX per indicare pdfLaTeX. Indichiamo la parte per il tutto; LaTeX è il linguaggio di mark up, comune a latex, pdflatex, xelatex, lualatex; questi quattro sono gli eseguibili di compilazione, i compilatori, basati su quel linguaggio. A quanto pare le confusioni ci sono, ma tutto sommato sono rare.
Erano più numerose negli anni ’90 quando pdflatex era appena nato; tra biber e bibtex le confusioni ora sono frequenti perché il tempo di biber è cominciato da poco.