Gruppo Utilizzatori Italiani di TeX
Dovresti definire a mano il bounding box. Più semplicemente: `\node at (2,-0.5) {$5\vphantom{\dfrac{2}{3}}$};` al posto del primo nodo, riserva lo spazio per scrivere 2/3, anche se in realtà scrive solo 5.
Ciao