Azzardo questa ipotesi: il linguaggio pdf è il linguaggio di pdftex, il vero motore di composizione di pdflatex. Il linguaggio nativo di XeLaTeX è un dviesteso per gestire caratteri unicode, poi il driver esteso che trasforma il file dvi in file pdf va ben ma è solo un traduttore, non è pdftex; non mi stupirei se l’errore (Warning) cona la mancata incolsione di quella figura, dienda dal traduttore dvu -> pdf.
Per altro salvo qualche piccola differenza, xetex, il motore di ocmposizione di xelatex, e il traduttore da dvu a pdf fanno un ottimo mestiere fin dall’inizio, ma ci sono alcune piccole cose che si possono fare con pdftex e luatex (in verità con lua tex se ne possono fare molte di più anche rispetto a pdftex, grazie all’inteprete incorporato del linguaggio Lua), ma non si possono fare con xetex.