prima cosa ti sconsiglio di chiamare i file 1.tex è meglio dargli un nome logico. dal punto di vista del risultato non cambia niente, ma ti assicuro che capito di dover cambiare l’ordine a posteriori.
\include semplicemente “copia” nel punto in cui lo metti tutto quello che incontra, quindi non si pone nessun problema, te hai vari file ma LaTeX li vede come un unico file sequenziale.
logicamente se commenti un include tutti i riferimenti cambiano, perché quello che era il capitolo 2 diventa 1 etc. in questo senso intendevo che se vuoi i contatori giusti lo devi fare a mano, ma normalmente è un problema che non si pone, te compili a pezzi per comodità e poi compili il tutto alla fine.
con emacs è facile compilare direttamente da un file figlio il file madre, in maniera da non dover cambiare sempre finestra. basta mettere alla fine del file figlio
`
%%% Local Variables:
%%% TeX-master: “main.ltx”
%%% End:
`
e poi da dentro il file figlio facendo C-c C-c si compila main.ltx
con winedt non lo so ma puoi cercare nella guida, probabilmente esite qualcosa di analogo.
ciao
f