Per fare stare tre immagini su una riga, la somma della loro dimensione in larghezza non può superare \textwidth. Quindi, immaginando di volerle tutte della stessa larghezza, devi impostare il parametro opzionale di subfigure width=0.33\textwidth.
`\begin{figure}[htbp]
\centering%
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm1}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media1.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm2}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media2.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm3}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media3.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm4}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media4.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm5}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media5.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm6}]%
{\includegraphics[width=0.33\textwidth]{rsm_media6.jpg}}
\caption{Superfici di risposta\label{fig:suprisp}}
\end{figure}`
Questa è la dimensione massima per far stare le immagini su due righe, e quindi non ti servono neanche più i comandi di spaziatura \qquad dopo ciascuna subfigure.
Se vuoi le immagini più piccole cambia il parametro width. In tal caso ti consiglierei però di usare, invece del doppio \qquad, il comando \hfill dopo la prima, la seconda, la quarta e la quinta subfigure, così da ottenere una spaziatura uniforme per qualunque larghezza delle immagini. In pratica:
`\begin{figure}[htbp]
\centering%
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm1}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media1.jpg}}\hfill
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm2}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media2.jpg}}\hfill
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm3}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media3.jpg}}
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm4}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media4.jpg}}\hfill
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm5}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media5.jpg}}\hfill
\subfigure[\protect\url{}\label{fig:rsm6}]%
{\includegraphics[width=X\textwidth]{rsm_media6.jpg}}
\caption{Superfici di risposta\label{fig:suprisp}}
\end{figure}`
dove X<0.33 e serve anche il comando \newline dopo la terza subfigure.
Ciao,
Paolo