Già ho perso la scommessa, ma solo a metà: riguarda il file che hai allegato:
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\documentclass[a4paper,12pt,oneside,pdflatex,ngerman,english,italian,final]{article}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage{hyperref}
\setcounter{secnumdepth}{0}
\hyphenation{con-fi-gu-ra-zio-ni}
\makeindex
\begin{document}
\input{file1.tex}
\tableofcontents
\end{document}
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Le opzioni per l’inglese e l’italiano oltre che per il tedesco col lo spelling moderno le ha specificate alla classe, ma ti sei scordato di chiamare babel; aggiungilo e vedrai che le cose andranno un po’ meglio.
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\documentclass[a4paper,12pt]{article}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage[ngerman,english,italian]{babel}
\usepackage{hyperref}
\setcounter{secnumdepth}{0}
%\hyphenation{con-fi-gu-ra-zio-ni}
\makeindex
\begin{document}
\input{file1.tex}
\tableofcontents
\end{document}
`
Ovviamente compili con pdflatex e se vuoi una versione che non sia final, eventualmente aggiungi l’opzione draft alle altre due opzioni rimaste a \documentclass.