Francesco, il fato che le pagine pari e dispari abbiano lo specchio di stampa spostato verso il margine interno è una cosa che disturba i neofiti, ma è quello che ogni impaginazione ben fatta dovrebbe sempre realizzare; quando hai un documento (libro) aperto vedi due pagine affacciate e se gli specchi fossero centrati su ciascuna pagne lo spazio bianco al centro sarebbe eccessivo.
La soluzione dell’opzione oneside è quella che risolve il tuo problema, perché appunto fa riferimento ad una pagina singola senza badare a come appaiono due pagine affacciate. Naturalmente quella opzione ha anche altre conseguenze; per esempio che le testatine e i piedini sono identici per cui non hai la doppia informazione che potresti avere con le testatine e i piedini delle pagine affacciate composte in modo diverso e con contenuti diversi.
Puoi provare a leggerti la documentazione delle classi Koma-script, la guida scrguien.pdf (da terminale dai il comando; texdoc scrguien) e vedi se puoi usare il comando \areatype (o qualcosa del genere) che ti permette di specificare la tua geometria della pagina; puoi ottenere l’aspetto twoside con testatine diverse, ma con gli specchi di stampa centrati in ciascuna pagina. Questa soluzione va bene per un documento da leggere sullo schermo, ma non va bene per un testo su carta.