Re: problema: prima pagina indice, capitolo e bibliografia

Ti sei spiegato benissimo.
Usa \frontmatter all’inizio e \mainmatter subito prima del primo capitolo vero.
Ridefinisci lo stile di pagina plain in modo che faccia quello che metta il numero di pagina dove vuoi tu; l’indice e la altre cose che hanno direttamente o indirettamente il comando \chapter, usano lo stile plain per la pagina che contiene il titolo.