Ok il file in questione che prima (per esempio) ho chiamato {file}, si chiama {tesiinfo}:
…
Evito di commentare quel codice. Da quello che posso capire non prevedono capitoli non numerati. Togli la chiamata di fancyhdr, perché vogliono uno stile loro (brutto).
Meglio se il tuo preambolo è così:
`\documentclass[a4paper,12pt]{file}
%%Pacchetti
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage[italian]{babel}
\usepackage{microtype}
\usepackage{subfig}
\usepackage{color}
\usepackage{listings}
\lstset{language=PHP}
\definecolor{darkgrays}{rgb}{0.95,0.95,0.95}
\lstset{numbers=left, numberstyle=\tiny, stepnumber=1, numbersep=1pt,
keywords={wait,case,else,elseif,end,for,function, class, construct,extends,
if,assign,while}}
\lstset{framexleftmargin=5mm, frame=single}
\lstset{linewidth=\textwidth, showstringspaces=false}
\lstset{keywordstyle=\bfseries\emph}
\lstset{backgroundcolor=\color{darkgrays}}`
Il pacchetto graphicx non serve perché lo carica già la classe; subfigure è obsoleto da anni. Meglio se carichi anche fontenc e microtype.
Ciao
Enrico