Credo che un supporto pieno a animazioni 3D di questo tipo si ottenga solo visualizzando il PDF con Adobe Reader.
Pure io credo che le cose stiano così. A quanto mi risulta per includere animazioni in PDF si ha sempre a che fare con Javascript, anche se non mi ci sono mai messo a sperimentare. Okular semplicemente ha un supporto praticamente nullo per Javascript. Stessa cosa per Evince. Addirittura pare che anche le versioni di Acrobat Reader per Linux (quando ancora lo distribuivano) non supportassero pienamente le animazioni.
Il pacchetto animate è fatto esplicitamente per le animazioni (quindi mediante javascript).
Il pacchetto movie15, oltre alle animazioni, può includere video (mpeg), che forse hanno un più ampio supporto. Ma non sono quello che vuoi (forse, li puoi usare come ultima spiaggia).
Forse c’è una terza via: SWF, ma credo che sia forse ancor meno portabile del Javascript.
Prova a dare un’occhiata qua.
Antonio