Scusate il ritardo con cui rispondo, ma sono tornato solo oggi a Pisa dal ponte.
Dunque, esiste un pacchetto che afferma di implementare una specie di source specials per pdf. Il pacchetto si chiama vpe, è costituito dai file vpe.sty e vpe.pl, e si trova, insieme ad altra roba, nella directory oberdiek: questo su CTAN e su MiKTeX.
Non l’ho mai usato e quindi non so se e come funziona, ma da quello che si trova sulla scarsa documentazione (vpe.txt) mi pare di capire che il lavoro vero e proprio venga effettuato dallo script di perl vpe.pl, che però non è distribuito con MiKTeX (ma sul CTAN c’è!). Il pacchetto è vecchio (2000), richiede Perl5 e che venga abilitata, per il compilatore pdftex, l’opzione \write18. Non so quindi quanto sia coveniente usarlo, soprattutto con le nuove versioni di Acrobat.
Ricordo poi di aver letto, nell’elenco dei todo di AucTeX, che era in programma l’implementazione di un poor man source specials, ma credo che questo sia di là da venire…
Comunque rimane l’altro punto, come diceva Fabiano, quello più importante: se non si trova un software free per fare annotazioni su pdf, le possibilità di interscambio tra chi usa LaTeX e chi no sono molto limitate.
Ciao,
Max.