Le note, che siano al piede o siano a fine documento, sono sempre note. Quindi devono essere composte nello stesso modo; di conseguenza usa un qualunque pacchetto per cambiare il modo di comporre le note.
Poi ricordati: non l’ho detto io, ma lo dicono persone molto più autorevoli di me: ti basta quello di Bringhurst? Le Note a fine volume sono uno spreco di carta e di inchiostro; sono fatte per NON essere lette; le note, che in primo luogo devono essere ridotte al minimo, devono essere vicino al luogo dove sono richiamate. so che in ambito umanistico sono piuttosto diffuse, ma anche Bringhurst scriveva essenzialmente per gli umanisti, visto che quel poco che scrive di matematica è totalmente insufficiente per scrivere la matematica altrettanto bene del testo.