In ogni caso il comando \label va sempre messo dopo all’elemento che attribuisce il numero dell’oggetto a cui ci si vuole riferire; non sempre questo elemento è evidente, ma nel caso di \caption è chiarissimo che è lui a generare al didascalia numerata, quindi \label va messo dopo. per le equazioni il numero viene incrementato prima di scrivere l’equazione da \begin{equation}, ma negli incolonnamenti di amsmath la documentazione indica di mettere il \label subito prima di \\ o di \end{…}. Io quindo per essere sicuro metto semrpe il ‘lable dopo l’elemento numerato, dopo le equazioni, dopi i \caption delle tabelle e delle figure, dopo le aperture dei teoremi,ovviamante dopo i titoli delle varie sezioni \chapter, \section, …, eccetera.
Come dice Lorenzo, bisogna studiarsi bene l’ Arte di scrivere con LaTeX