Ciao,
io questa primavera ho dato una mano alla morosa con la sua tesi. Lei aveva un sacco si spettri di uno spettrometro MALDI-TOF, ma la sostanza non cambia.
La mia idea iniziale era di usare pgfplots, ma purtroppo non riusciva a gestire la mole di dati contenuti nei txt, anche provando a modificare i parametri (vedi la sezione 6 del manuale di pgfplots).
La mia idea è questa: prova con pgfplots, riesci tranquillamente a inserire le etichette e mantieni facilmente la coerenza del font delle etichette degli assi con quella del documento.
Se non riesci, io avevo usato un software esterno (Plot per MAC, secondo me il sw che dà il miglior risultato estetico, molto meglio di origin, qtiplot, scidavis, che ho provato, peccato non sia più aggiornato da anni) per fari i grafici e li avevo esportati in pdf, avendo cura di proporzionare bene il tutto in modo che la dimensione dei font delle etichette fosse quella che volevo io. Su windows, non saprei che consigliarti, forse giocando un po’ con qtiplot si ricava quacosa di bello.
Per come strutturare il codice, guarda la sezione “reading data from files” della guida di pgfplots.
Fran