A me risulta che la prima volta che TeXworks viene usato si cerca tutte le cose che gli servono, io non ho mai avuto bisogno di configurare nulla; comunque sotto Preferences, vai a vedere che cosa c’è scritto nel pannello che si apre cliccando su Typesetting e nella finestra in alto ci sono i path che puoi editare se vuoi o anche mettere in una sequenza diversa (te lo sconsiglio); nella finestra in basso ci sono tutti i motori di composizione per ai quali potresti aggiungerne degli altri e comunque li puoi mettere in ordine diverso, cosicché quando lavori e hai bisogno di cambiare eseguibile nella finestrina accanto al bottone verde ti appaiono in ordine quelli che usi più spesso e poi quelli che usi raramente, secondo come ti sei configurato le cose.
Accanto a questa seconda finestra hai anche il tasto edit che ti permette di aggiungere opzioni alla riga di comando. Il file Help/Aiuto non spende troppe parole sulla sintassi e sulla scrittura di queste opzioni, ma non è difficile immaginare ed estrapolare da quel che vi si dice esplicitamente. Io non ho mai avuto bisogno di modificare nulla perché così come è preimpostato mi funziona nella stessa maniera sul Mac, su una macchina virtuale WXP e su una macchina virtuale Ubuntu 11.10.
Il pannello delle Preferenze ha anche altre sezioni e ti permette di scegliere a tuo piacimento tutto quello che ti pare e che è personalizzabile; per esempio non ti lascia scegliere un altro visualizzatore PDF, ma puoi usare solo il suo visualizzatore interno (che è talmente ben integrato con l’intero software, che sarebbe un suicidio cambiare con un altro visualizzatore esterno.