Nella Tesi Moderna non ho visto specificazioni di font di nessun tipo; da un lato è giusto, ma se uno non ha installata un versione sufficientemente completa, usando i font con codifica T! senza specificare nessuna collezione, vengono usati i CM-super; spesso questo sono assenti dalle distribuzioni di base; Se @Zippo ha una distribuzione di base, aggiunga nel preambolo una specidiifcazione, per esempio \usepackage{lmodern} e controlli che nella sua installaziione ci siano.
Piuttosto LayAureo usa le opzioni della forma key=value, in particolare binding=5mm; a me esce l’errore:
`
/Users/claudio/Library/texmf/tex/latex/base/local/layaureo.sty:63: Package keyv
al Error: binding undefined.
See the keyval package documentation for explanation.
Type H
…
l.63 \ProcessOptionsWithKV{LayAureo}
`
Io proseguo comunque dando nella console il comando S, il il file PDF viene prodotto regolarmente; non sono in grado, però di dire se i 5mm siano stai ignorati o ne abbia tenuto conto comunque.