Come si faccia in LyX non lo so e non ci penso nemmeno, perché questi editor alla LyX sono più delle palle al piede che altro.
Lavorando con un editor qualsiasi fra quelli che vengono consigliati sempre qui sul forum, si gestisce ogni dettaglio di composizione in ogni minimo dettagli, senza enormi pallae da carcerato ad entrambi i piedi; per esempio uno sceglierebbe di usare il pacchetto natbib, uno stile di citazione (anche se non lo usa) del tipo author year, e potrebbe scegliere un qualsiasi stile bibliografico che poi natbib gestisce adeguatamente; ovviamente bisogna leggere la documentazione di natbib che anche voi LyXiani potete leggere da terminale dando il comando texdoc natbib. Poi come inserire con LyX i comandi LaTeX per usare natbib e specificare le altre impostazioni è un affare vostro.
Scusate, non voglio né insultavi perché usate LyX, né meno che mai deridervi; vi ricordo solo che quando salta fuori la parola LyX qui sul forum, la prima cosa che si dice è sempre:
prima lasci perdere LyX, prima vivi felice.