Per prima cosa non aver mai paura di zippare un file log perché è rigorosamente scritto con caratteri a 7 bit; i pochi caratteri a 8 bit, oppure unicode, sono talmente rari che il testo si capisce lo stesso anche con quei caratteri sostituiti da segni strani. Un file word contie alcune decine di kibibyte in più che non servono a niente.
Veniamo al punto: sembrerebbe che il file PROVA2.TOC verso le righe 165 e 166 contenga dei caratteri matematici sbagliati o male interpretati. Allora questo sigitica che hai messo delle espressioni matematiche nei titoli di alcune sezioni.
Questo in generale non va bene; se usassi un editor qualunque e non LyX, ti direi: lascia pure el formaule nei titoli delle sezioni, ma fa in modo che non vavano a finire nell’indice usando l’argomento facoltativo del comando \section (o del comando di sezionamento che usi). Siccome usi LyX, l’unica cosa che ti posso idre è: non scrivere formule matematiche nei titoli delle sezioni; esprimi lo stesso concetto a parole.