Luca, leggi con attenzione la documentazione di nomencl dando da terminale (o prompt dei comandi) il comando texdoc nomencl
In ogni caso il processo con cui si crea la lista degli acronimi con nomencl avviene in modo molto simile a quello con cui viene creato un indice analitico.
certamente, quindi, devi fare andare almeno una volta la composizione del documento, poi da terminale devi dare il comando giusto con le opzioni giuste, come ti è spiegato con esempi nel file di documentazione di nomencl; devi esplicitare l’estensione del file che contine l’elenco delle abbreviazioni che ti è stato predisposto nell’esecuzione precedente, e se vuoi puoi specificare il nome di uno stile di composizione dlal lista degli acronimi. poi la lista apparirà nel tuo documento alla successiva esecuzione del programma di composizione, ma il file sorgente.tex deve contenere il comando giusto per immettere il file prodotto da makeindex, ma che ha una estensione diversa da .ids.
È tutto raccontato nella documentazione di nomencl.