Se il tuo computer è Windows, dir ti da l’elenco (directroy = elenco) dei file; se sei su una macchina Mac o Linux allora il comando equivalente è ls (list= elenco).
A parte spostarti nella cartella giusta come ti ha detto @Spike (se sei in grado di riportarci il file .aux, vuol dire che sai in quale cartella si trova, quindi devi dire nel terminale di usare quella cartella come default; il comando [Windows, Mac, Linux] è sempre cd seguito dal percorso relativo o assoluto della cartella che vuoi specificare), il terminale non ha questa schizofrenie, ma TeX sì: in generale non gli piacciono i nomi dei file con l’underscore o con gli spazi al punto che per usarli bisognerebbe racchiuderli far le virgolette doppie diritte (nella tastiera svizzera non so su che tasto siano, ma è il segno ” tanto per intenderci).
Certo che quando dai il comando pdflatex CV_long_en e pdflatex ti dice che non trova il file su cui lavorare, vuol dire che proprio la cartella dove si trova il file non è quella giusta. Dai un’occhiata alla Guida tematica alla riga di comando, all’indirizzo /wp-content/uploads/joomla-images/doc/GuideGuIT/guidaconsole.pdf; è molto utile. Tra l’altro vi dovresti trovare il significato di percorso relativo e di percorso assoluto e il significato di Home (~) sulle macchine Mac e Linux.
Vedo dal tuo file .aux che usi \nocite{*}, quindi le informazioni necessarie sembrano esserci tutte perché bibtex possa fare il suo lavoro.