Sono su Mac/TextMate e di solito apro i pdf dei pacchetti tramite help di TextMate che li indicizza in automatico. Forse per questo non ho mai trovato definizione di \makeatletter: indagherò più a fondo!
Anch’io sono su Mac, ma non conosevo nemmeno l’essitenza di TextMate; texdoc mi basta e avanza, ma capisco benissimo che se uno avesse interesse per alte cose, tip e-books, si doterebbe di certo di qualcosa di molto piè efficace.
Per altro [tt]\makeatletter[/tt] e [tt]\makeatother[/tt] sono due comandi indicati da Leslie Lamport in persona, il papà di LaTeX, e sono riportati tradotti in italiano nel Latex Reference Manual commentato, qui sopra nelle guide tematiche; dubito che TextMate ti indicizzi anche quelle guide. Poi c’è sulla GuidaGuIT, qui sopra nella Documentazione e si spiega anche che cosa fa e perché è talvolta necessario usare questi comandi.