Ci possono essere molti motivi per i quali il tuo file pdf presenta i fot sgranti quando ingrandisci.
UNo potrbbe essere, ma tiro ad indovinare perchè non dai abbastanza dettagli, che tu abbia una versione molto basic di MiKTeX e che quindi tu non abbia caricato i font cmsuper e nemmeno i Latin Modern, ma tu abbia specificato al codifica dei font con la sigla T1.
Quindi parti da Avvio | Programmi | MiKTeX | 2.9 | MiKTeX settings e scegli il package manager; con quello tu poi vedere quali pacchetti ti sono stati caricati con la versione Basic, e puoi spuntare i pacchetti che vuoi caricare. Quando avrai caricato i font vettoriali, anche il tuo pdf (dopo aver ricompilato) apparirà come si deve.
La cosa migliore che tu possa fare è quella di disinstallla re la tua versione basic, e dalla pagina di MiKTeX in rete scarichi lo script per installare la versiona completa. Ti ci vorrà un poò di tempo per installare la versione completa, am ti grantisco: vale la pena. Il genere di problemi che hai incontrato non si presenterà più.