Bé imakeidx serve solo per l’indice analitico, quindi se vuoi scriverlo in numeri arabi, che cosa devi modificare,? niente!, second tradizione metti l’indice analitico nella backmatter. la quale non ricomincia la numerazione.
Se vuoi l’indice generale in numeri romani basta che tu lo componga nella frontmatter.
Se non vuoi che la mainmatter ricominci la numerazione delle pagina da 1, memorizza il valore del contatore page in un contatore a tuo piacimento poi dopo aver dato il comando \mainmattter carica il contatore page con il valore memorizzato a seconda di quello che ci metti dopo può darsi che tu debba aggiustare il contaotre page con i soliti comandi \setcounter, \addconunter e simili.
A me non sembra una buona idea, tuttavia sai ora come fare.