@Doc: ho verificato che in effetti se nel sistema si imposta il layout greco (per esempio variante politonica) Emacs riconosce le lettere come greche ma non sembra permettere l’inserimento dei segni diacritici. Leggendo la guida ho letto che il tuo sistema di inserimento preferito è Ibycus. Emacs lo supporta (oltre ad altri sistemi di inserimento postfissi), per provarlo: [tt]M-x set-input-method RET greek-ibycus4 RET[/tt]. Una volta impostato, per disattivarlo: [tt]C-\[/tt] e per riattivarlo sempre [tt]C-\[/tt]. Puoi vedere la descrizione completa con [tt]C-h I greek-ibycus4 RET[/tt]. Ho visto che conosci anche Greek Babel, Emacs ha anche quello ([tt]greek-babel[/tt]).
Comunque ho più o meno capito come realizzano queste mappature per i segni diacritici, se sei interessati potrei darti una mano a realizzare quella che più ti piace