Può essere colpa dell’editor; TeXLive dal 2010 può usare la capacità di eseguire dei programmi esterni; per motvi di sicurezza questa facoltà è disabilita; per impostazione predefinita dal 2012, mi pare, può eseguire un piccola lista di eseguibili protetti e questa pssibilià “protetta” è preimpostata.
Allora, prova a lanciare una compilazione dalla finestra comandi e poi leggi il file log; se nel file log c’è scritto “protected write 18 enabled” (o qualcosa del genere, eprché sto scrivedo da un PC non mio dove il sistema TeX non è installato), allora vuol dire che è l’editor che lancia pdflatex con l’opzione sbagliata di NON usare la funzionalità write 18 nemmeno in modalità protetta. In questo caso configura l’editor perché non ti metta i bastoni fra le ruote.
Se invece anche da terminale nel file log c’è scritto che write 18 è disabilitato, allora c’è qualcosa che non va nell’installazione. Leggi con texdoc la documentazione texlive: texdoc texlive e vedi come riesci a cambiare le impostazioni per abilitare il write 18 protetto.