OK, il file bibliografia.bib è evidentemente essenziale, ma biber ha bisogno di leggere quel file aux per sapre che cosa deve fare; ecco perché non viene prodotta la bibliografia.
Dunque bisogna capire perché salla tua macchina pdflatex riesce a scrivere il file aux, ma non riesce a riaprirlo per leggerlo, confrontarne il contento con quanto dovrebbe contenere e poi per scriverci dentro gli aggiornamenti.
Controlla quali diritti hai come utente; possibilmente abilitati come utente privilegiato o come amministratore; controlla che non ci siano impedimenti a leggere o scrivere i file; per esempio apri il prompt dei comandi, scrivici dentro attrib nomedelfileprincipale.* poi premi il tasto invio; sullo schermo dovrebbero apparirti gli attributi di permesso di lettura, scrittura, esecuzione, di tutti i file che hanno quel nome e con le varie estensioni ,tex, .aux, .log, eccetera. Quali lettere compaiono accanto al file .aux?