Non è una impostazione automatica, quindi la devi specificatre tu nel preambolo:`\pdfpagewidth=\paperwidth
\pdfpageheight=\paperheight`
È una di quelle impostazioni di cui ci si scorda sempre, una volta installato il sistema TeX, perché fra le varie impostazioni c’è scritto anche di specififare il formato di default della carta; questa specificazione va a finire nel file di configurazione del programma pdftex (texlive/2013/texmf-config/tex/generic/config/pdftexconfig.tex).
Se apri questo file vi trovi scritto fra altre cose:`\pdfpagewidth=210 true mm
\pdfpageheight=297 true mm`e i valori specificati in millimetri veri sono valori assoluti; quando specifichi l’opzione a5paper imposti la dimensioni della carta per il programma di composizione, ma non lo comunichi a pdflatex, solo al generico programma di composizione, che pottebbe essere latex, invece che pdflatex. Quindi tocca al compositore preoccuparsi di informare pdflatex che le dimensioni della pagina effettiva sono diverse da quelle di default, Se usi le specificazioni che ti ho sugggerito allinizio, quelle vanno bene sempre, anche se specificassi letterpaper oppure b5paper o qualsiasi altro formato.
Questo è quello che avviene con le classi standard; ci sono altre classi, come memoir, che hanno una gestione complessa della carta(stockpaper, page, paper, eccetera) e consentono di gestire queste cose in modo un poco più complesso a secondo di quel che si vuo, fare; per esempio si potrebbe scegliere al carta A4, per scriverci pagine A5, da imporre a coppie sul foglio A4 in landscape, per poter comporre libretti più piccoli semplicemente piegando le pagine; le possibilità sono molto numerose, ma bisogna leggerne la documentazione per sapere esattamente come fare.