Nota che le linee dei capitoli sono in maiuscolo nero e i rispetivi numeri di pagina ono neri; invece le righe dei paragrafi sono mediamante chiari, i loro numeri di pagina, uno dopo l’altro sono chiari, se non ci fossero i punti guida l’occhio potrebbe sbagliare riga. Con le righe dei capitoli ciò non succede di siscuro.
Nota che il discorso dei numeri delle pagine allineati sul margine di destra è una cosa che alcuni apprezzano ed altri non apprezzano per niente. Sa hai guardato l’indice dell’Arte di scrivere con LaTeX, vedi la differenza. Niente puntini in nessuna riga, numeri delle pagine vicino ai titoli.
Se tu volessi assolutamente i puntini anche sulle righe dei capitoli potresti farlo ridefinendo il comando del nucleo di LaTeX (in realtà anche della classe con cui componi) che si chiama \l@chapter.
Non te lo consiglio: se vuoi sapere perché, scaricati la lunga Guida GuIT dalla sezione Documentazione di questo sito e vai a leggere il paragrafo dedicato ai “leaders”.
Che cosa succede nell’ultima riga? È impossibile dirlo senza vedere almeno il tuo preambolo, o almeno un esempio minimo compatibile.Magari riguarda come hai scritto il comando con cui dici di volere il titolo dell’ultimo indice nel file sorgente; forse ti manca una graffa, forse sei indeciso se mettere \con \addcontetsline quella voce nella toc (table of contets, o nella lof (list of figures); occhio! ci vuole solo lof