La tua domanda sulla forma delle note, ciò lo stile del richiamo, gli spazi, gli allineamanti non si risolvono facilmente, seocndo me, con le funzionalità di footmisc.
Ma, non so quanto ti dico ti piaccia o no, ma quello che tu chiedi si può personalizzare facilmente con le funzionalità della classe memoir; se tu non esprimi opzioni e se non specifichi nessun comando di perosnalizzazione memoir produce gli stessi risultati della classe book. Ma è completamnte personalizzabile; in particolare il capitolo 12 che comincia nella pagina 231, tratta quanto tu richiedi, solo che devi avere pazienza di arrivare fino al § 12.1.2 per vedere i comandi di personalizzazione. In parricolare i comandi che mi sembrano che faccinao al caso tuo mi sembrerebbero \footnotemakstyle, \footnotemarkwidth, \footnoteparindent, \footnotefont. In particolare se \footnotemarkwidth è nullo, il mark della nota in calce alla pagina viene messo a filo del margine complessivo, senza sporgere nel margine esterno; \footnotemarksep separa il segno dall’inizio del testo della nota, che può venire ulteriormente rientrato dell’ammontare specificato per \footnoteparindent. Le righe successive, però hanno il margine giustificato a sinistra allineato con il margine del testo principale.
Mi sembra che tutto ciò potrebbe risolvere i tuoi problemi; tentare non nuoce, ma abbi la documentazione aperta accanto a te; non devi leggere tutte le centinaia di pagine che texdoc memoir ti può mostrare, ma devi conoscere a fondo almeno il capitolo 12.