Però ricordati che non potrai fare riferimenti incrociati.
Se nel capitolo 1 hai 5 figure, nel capitoo 2 hai 8 figure e nel capitolo 3 vuoi citare la figura 4 del primo cpaiolol devi mettere un label a quella figura, po magari defi citare anche la figura 4 del secondo capiotlo; quando scrivi: “.. come si vede nella figura\ref{fig:primocapitolo-quartefigure}…” nel file composto ti uscirà: “… come si vede nella figura 4…”.
Ma a quel punto quale figura 4?
La numerazione gerarchica serve apposta per quello; se stacchi con chngcounter come ti è stato consigliato il contatore delle figure dal contatore dei capitolo avrai le figure numerate in modo univoco, ma poi avrai il capitol o2 la cui prima figura è numerata 6; Hai mai visto un libro serio con le figure numerate così?
In sostanza ti sconsiglio di fare quello che vorresti fare; anche se è possibile tecnicamente, è brutto tipograficamante.