Gli overfull non sono errori veri e propri, ma degli avvertimenti. Significa in quel punto il programma non è riuscito costruire una riga che stia nella gabbia del testo e quindi questa sborderà di lato di una certa quantità (che viene indicata). Overfull di pochi pt sono trascurabili (tieni conto che un pt, punto tipografico, è approssimativamente un terzo di millimetro, per cui fino a 3pt puoi trascurarli) 😀
Per quanto riguarda gli altri errori delle lettere non riconosciute, l’unica è controllare come ti ho mostrato primo uno per uno gli errori e riscrivere le lettere o scriverle con i comandi LaTeX (a esempio la dieresi la potresti inserire come [tt]\”{u}[/tt]). Sono conscio che sostituire le lettere non è comodo, ma fino a che non perveniamo a una soluzione è l’unica cosa che mi è venuta in mente.