Può darsi che io non abbia l’ultima verisone degli EBGaramond, ma la mia distribuzione TeXLive {MacTeX) 2014 è aggiornata a due giorni fa e non contene il file ebgm_6w53db.enc.
Dove il to file trovi quel nome non saprei dirlo, ma quel nome non compare né nei file .enc relativi agli EBGaramond, né dentro il file pdftex.map, quello che pdftex (il motore di pdflatex) esamina per sapere di quali font Type 1 reali o virtuali disponga.
Prova a rigenerare il file di mappa; leggi con attenzione la documentazione di tlmgr e di texlive per sapere come fare. È succintamante descritta anche nella guida GuIT e nella guida tematica sui font. Non è un’operazione difficile, ma è decisamente delicata. Yutta l’operazione deve venire eseguita da terminale e con i privilegi di amministratore.