Personalmente non ho avuto nessunissimo problema quando ho messo yosemite…
Che versione di TexShop hai cercato di aggiornare?
Perché a me un annetto e mezzo fa dava lo stesso problema che poi ho risolto scaricando TexShop dal sito dello sviluppatore e semplicemente sostituendo l’applicazione nella cartella applicazioni (i link per il download sono in alto a destra)
http://pages.uoregon.edu/koch/texshop/index.html
Da quel giorno in poi sono riuscito ad aggiornare TeXShop mediante il suo aggiornamento automatico.
L’idea che mi ero fatto io era che il problema fosse di quella specifica versione di TeXShop quindi se hai la stessa versione che avevo io all’epoca probabilmente il problema è lo stesso.
Per la codifica…
questo deve funzionare
`
% !TEX encoding = UTF-8 Unicode
% !TEX TS-program = pdflatex
\documentclass[a4paper]{book}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\begin{document}
àèòù
\end{document}`