Non credo ci sia niente di anomalo in quel che ottieni; ho esaminato a fndo i file, ma non è quello che ti sembra.
Gli esempi che hai fatto con \si e \SI sono corretti, ma ti appaiono sbagliati perché stai usando in font euler in cui il tondo matematico è così simile al corsivo matematico che non si distinguono quasi.
Invece gli esempi che fai con \ensuremath non vengono usati i font euler, am in font testuali per il tondo matematico; i Palatino i i Minion che classicthesis invoca, e quindi anche tesiclassica, hanno la codifica giusta da usare in matemarica, la codofica OT! per il tondo che invochi con \mathrm, ma questo font non contiene le lettere greche minuscole, quindi il trattino è il glifo che quel carattere contien al posto della lettera \mu.
Se hai davvero bisogno di usare unità di misura e vuoi davvero usare i font euler, allora usa tranquillo i comandi del pacchetto siunitx; Ma se il risultato non ti piace devi cambiare classe, perché il pacchetto classicthesis è stato caricato con l’opzione eulermath e non c’è modo di farglielo dimenticare, se non reimpostare i comandi di basso livello per rimettere i font matematici di default.
Al meglio, forse, puoi editare la classe tesiclassica (cambiandole nome) e togliendo dalla invocazione del pacchetto classicthesis l’opzione eulermath.
Meglio ancora segui il modello TesiMod, che usa la classe tesimoderna che usa i siliti caratteri Latin Modern testuali e matematici.
Il disengo della gabbia è fatto secondo la proporzione aurea e il risultato finale non è affatto male. MA almeno non hai gli euler fra i piedi; scusa se li tratto male, ma sono anni che sto informando tutti che gli euler vanno bene solo per Knuth e per testi di matematica pura, dove non è necessario ottemperare alle norme ISO/UNI; font bellissimi, ripeto, ma inadeguati per rispettare quelle norme.
[attachment=1228]tesimoderna.zip[/attachment]
Ti allego il file tesimoderna.cls dove ho scoperto un errore e l’ho corretto.
Ho provato a far andare l’esempio che mi avevi mandato e le unità vengono benissimo, tranne che con \ensuremath, dove i ofnt sono corretti, ma il simbolo di micro viene in corsivo greco matematico, perché specificando \mathrm le lettere greche miniscole non sono disponibili. con siunitx, invece funziona tutto a meraviglia.