Latex ha due possibilità (suppongo che stai usando miktex): il comando latex che genera il dvi o il comando pdflatex che genera pdf.
La differenza tra le due, a parte questioni tecniche, è la gestione delle immagini. latex gestisce direttamente gli eps, mentre pdflatex preferisce le immagini in pdf o png. (troverai tonnellate di post su questo problema).
Se usi quindi gli eps ti conviene generare il dvi che correttamente visualizza le immagini. Se poi da quello vuoi generare un pdf, si può convertire il dvi in pdf con l’utility dvi2pdf che prende in input il tuo dvi e genera un perfetto pdf (a parte i riferimenti cliccabili, ma è un altro problema).
Non uso Texniccenter, ma suppongo che anche lui, tra i pulsanti come winedt, abbia un link per generare correttamente il pdf da dvi.
Altrimenti la sintassi è semplice
dvi2pdf nomedelfile senza estensione da prompt dei comandi (ovviamente nella cartella appropiata)
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