@samiel, mescoli diversi argomenti:
1) la versione sperimentale di microtype usabile anche con xelatex per la sola protrusione, non pe l’espansione si trova cercando in rete il nome microtype beta da microtype. Ripeto: funziona solo la protrusione, non l’espansione dei font; ricorda che XeTeX produce un file dvi esteso all’uso di UNICODE, che viene automaticamante convertito in PDF; è un po’ come usare LaTeX+dvipdfm; solo pdftex riesce ad operare sui font a livello di espansione/contrazione die font e lo fa solo per quelli di cui essitono i file di descrizione specifici di microtype per specificare che cosa fare con ciascun glifo; se usi i tuoi Garamond con pdflatex e microtype, probabilmente non ha l’espansione dei font, ma solo la protrusione, perché mi sembra che questi particolar file non esistano per i font Garamond.
2) Il fatto che xelatex cerchi di creare con Metafont i file bitmapped degli URWGaramond è il comportamento normale dei motori di composizione del sistema TeX: trovano i file .tfm ma non trovano i pfb, allore suppongono che si tratti di font bitmpped di cui si dispone dei sorgenti .mf. Potrebbe significare che li hai installati, ma non compaiono nelle mappe generali; può darsi che questa mia affermazione sia una fesseria, perché xelatex è fatto per cercare i font opentype correttamente messi a disposizione/installati/indicati negli appositi file, non per cercare i font type1 nei file di mappa dvips.map o dvipdfm.map o pdftex.map; questo è un dettaglio che mi sfugge; ho usato talvolta font Tipe 1 con xelatex, ma ho evitato accuratamente di usare fontenc e di sostituire il mainfont con qualcosa a livello Type 1. Quindi manco di esperienza ma, a parte la domanda “ma chi te lo fa fare…”, che hai già previsto e hai già messo le mani avanti, capisco benissimo che si voglia imparare a capire come stanno le cose; quello che ho capito io è scritto nella guida tematica Font e tipografia che ti ho già indicato, ma ancora devo anch’io capire molte, moltissime cose.