In particolare non caricare mai il pacchetto type1ec; la sua utilità si riferisce solo ai font EC e CM, che spero tu non stia usando nemeno con pdfLaTeX, in compenso quel pacchetto distrugge la funzionalità di quei font che dispongono di copri ottici come i Latin Modern e alcuni altri. Suftesi carica di default i Latin Modern, oppure altri font senza corpi ottici, quindi type1ec non serve proprio a nulla.
Ovviamente usando XeLaTeX o LuaLaTeX segui quanto ti ha detto @Ivan; con questi programmi si lavora con font OpenType che non vengono gestiti da fontenc ma con fontspec (che mi pare sia già gestito da suftesi stesso).
Io personalmente per usare le funzionalità dei font OpenType e la migliore gestione delle lingue userei sempre la procedura indicata da @Ivan: la lavorazione con XeLaTeX e le versioni finali con LuaLaTeX. LuaLaTeX ancora ha qualche spigolo da smussare, ma lavora molto bene; XeLaTeX è ormai stabile e quando sarà stabile anche LuaLaTeX ho la sensazione che XeLaTeX potrebbe essere mantenuto in vita solo per retrocompatibilità.