Piccole correzioni: http://biccari.altervista.org/c/informatica/latex/sapthesis.php.
Sinceramente, invece di tutti quei calcoli che fai, userei il pacchetto geometry: la sintassi è molto più intuitiva: specifichi altezza, larghezza, separazione della testatina, rapporto alto/basso e destra/sinistra e sei a posto. C’è anche l’opzione heightrounded che produce un numero intero di righe di stampa, cambiando di quel che serve l’altezza della gabbia; così TeX ricorre meno a \parskip che, se la differenza è di qualche punto, può diventare evidente. Per fare le prove, ti consiglio di usare il pacchetto layout (lo trovi sulla Breve guida): fai qualche tentativo con geometry e confronti, dovresti arrivare alla forma richiesta in breve tempo e con meno fatica (a ricordarti tutte le operazioni che fai).
Per \marginparwidth ti suggerirei comunque una via leggermente più veloce:
`\setlength{\marginparwidth}{96pt}
\addtolength{\marginparwidth}{-\SAP@binding}`
Infatti il valore di \marginparwidth, quando la rilegatura è azzerata, viene 96pt (meno qualche decimo, per la verità, direi che è trascurabile).
Farei anche rientrare, almeno di un po’, le didascalie: così come sono confondono un pochino il lettore, secondo me. Con “margin=2pc” mi pare migliore, oppure 34pt, il doppio del rientro. Oppure uguale al rientro, vedi tu.
Ciao
Enrico