io credo che invece quel “per” stia ad indicare il settore delle circonferenza goniometrica su cui risolvere l’equazione, ma una scrittura del tipo \frac{\pi}{2}<\pi non ha senso proprio matematicamente, semmai \frac{\pi}{2}<\alpha allora potrebbe avere un senso; scritta cosi no!
altra cosa, \frac{3}{2}\pi è preferibile a \frac{3\pi}{2} anche se formalmente sono la stessa cosa.
nel primo caso quando usi align hai quel comportamento perché le & non sono casuali e servono proprio a latex a fargli capire dove incolonnare; prova con
`\begin{align}
\sin\alpha &= -\frac{7}{12} \text{ per } \frac{3}{2}\pi \\
\cos\alpha &= -\frac{3}{5} \text{ per } \pi<\frac{3}{2}\pi \\
\tan\alpha &= -\frac{12}{5} \text{ per } \frac{\pi}{2}<\pi
\end{align}`
anche se ribadisco scritte così secondo me hanno poco senso matematicamente.
In risposta al tratto più spesso ti chiedo che visualizzatore usi?
Io scrivo con texmaker che si porta YAP dietro come visualizzatore e secondo me lascia un po' a desiderare sulla grafica delle equazioni... apri con acrobat reader il pdf che crei (perchè compili in pdflatex vero?) e vdei se hai lo stesso problema.